Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTLA4P16410 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTLA4P16410 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTLA4P16410 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTLA4P16410 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms