Protein–RNA interactions for Protein: P16150

SPN, Leukosialin, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNP16150 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPNP16150 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPNP16150 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPNP16150 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPNP16150 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPNP16150 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPNP16150 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPNP16150 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPNP16150 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPNP16150 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPNP16150 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPNP16150 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPNP16150 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPNP16150 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPNP16150 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPNP16150 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPNP16150 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPNP16150 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPNP16150 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPNP16150 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPNP16150 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNP16150 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNP16150 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNP16150 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNP16150 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNP16150 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNP16150 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNP16150 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNP16150 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNP16150 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNP16150 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPNP16150 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPNP16150 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPNP16150 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPNP16150 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPNP16150 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPNP16150 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPNP16150 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPNP16150 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPNP16150 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPNP16150 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPNP16150 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPNP16150 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPNP16150 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPNP16150 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPNP16150 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPNP16150 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPNP16150 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPNP16150 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPNP16150 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNP16150 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNP16150 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNP16150 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNP16150 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNP16150 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNP16150 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNP16150 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNP16150 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPNP16150 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPNP16150 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPNP16150 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPNP16150 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPNP16150 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPNP16150 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPNP16150 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPNP16150 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPNP16150 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPNP16150 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPNP16150 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPNP16150 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPNP16150 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPNP16150 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPNP16150 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPNP16150 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPNP16150 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPNP16150 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPNP16150 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPNP16150 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPNP16150 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPNP16150 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPNP16150 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPNP16150 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPNP16150 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPNP16150 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPNP16150 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPNP16150 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNP16150 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNP16150 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNP16150 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNP16150 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNP16150 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNP16150 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNP16150 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNP16150 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNP16150 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNP16150 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNP16150 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNP16150 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPNP16150 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPNP16150 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms