Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN1P12814 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ACTN1P12814 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN1P12814 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms