Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNAT1P11488 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNAT1P11488 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNAT1P11488 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNAT1P11488 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNAT1P11488 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GNAT1P11488 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNAT1P11488 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNAT1P11488 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNAT1P11488 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GNAT1P11488 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GNAT1P11488 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNAT1P11488 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNAT1P11488 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNAT1P11488 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNAT1P11488 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GNAT1P11488 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GNAT1P11488 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GNAT1P11488 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms