Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ESRRAP11474 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms