Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PYGBP11216 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PYGBP11216 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYGBP11216 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYGBP11216 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PYGBP11216 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PYGBP11216 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PYGBP11216 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYGBP11216 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYGBP11216 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYGBP11216 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYGBP11216 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYGBP11216 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PYGBP11216 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYGBP11216 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYGBP11216 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYGBP11216 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYGBP11216 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYGBP11216 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYGBP11216 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PYGBP11216 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYGBP11216 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYGBP11216 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYGBP11216 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYGBP11216 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYGBP11216 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYGBP11216 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYGBP11216 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PYGBP11216 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PYGBP11216 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYGBP11216 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PYGBP11216 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYGBP11216 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PYGBP11216 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYGBP11216 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYGBP11216 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYGBP11216 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYGBP11216 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYGBP11216 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYGBP11216 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYGBP11216 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PYGBP11216 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYGBP11216 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYGBP11216 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYGBP11216 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYGBP11216 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PYGBP11216 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PYGBP11216 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PYGBP11216 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PYGBP11216 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PYGBP11216 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PYGBP11216 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYGBP11216 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYGBP11216 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PYGBP11216 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PYGBP11216 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYGBP11216 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYGBP11216 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYGBP11216 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYGBP11216 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYGBP11216 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PYGBP11216 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYGBP11216 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYGBP11216 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYGBP11216 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYGBP11216 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PYGBP11216 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PYGBP11216 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PYGBP11216 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PYGBP11216 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PYGBP11216 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PYGBP11216 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYGBP11216 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYGBP11216 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYGBP11216 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYGBP11216 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYGBP11216 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYGBP11216 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYGBP11216 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PYGBP11216 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYGBP11216 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PYGBP11216 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYGBP11216 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYGBP11216 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYGBP11216 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYGBP11216 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYGBP11216 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PYGBP11216 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYGBP11216 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYGBP11216 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYGBP11216 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PYGBP11216 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PYGBP11216 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PYGBP11216 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PYGBP11216 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PYGBP11216 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PYGBP11216 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PYGBP11216 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PYGBP11216 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PYGBP11216 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms