Protein–RNA interactions for Protein: P10721

KIT, Mast/stem cell growth factor receptor Kit, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KITP10721 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KITP10721 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KITP10721 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KITP10721 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KITP10721 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KITP10721 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KITP10721 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KITP10721 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KITP10721 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KITP10721 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KITP10721 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KITP10721 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KITP10721 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KITP10721 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KITP10721 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KITP10721 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KITP10721 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KITP10721 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KITP10721 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KITP10721 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KITP10721 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KITP10721 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KITP10721 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KITP10721 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KITP10721 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KITP10721 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KITP10721 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KITP10721 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KITP10721 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KITP10721 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KITP10721 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KITP10721 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KITP10721 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KITP10721 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KITP10721 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KITP10721 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KITP10721 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KITP10721 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KITP10721 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KITP10721 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KITP10721 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KITP10721 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KITP10721 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KITP10721 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KITP10721 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KITP10721 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KITP10721 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KITP10721 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KITP10721 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KITP10721 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KITP10721 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KITP10721 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KITP10721 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KITP10721 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KITP10721 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KITP10721 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KITP10721 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KITP10721 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KITP10721 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KITP10721 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KITP10721 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KITP10721 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KITP10721 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KITP10721 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KITP10721 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KITP10721 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KITP10721 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KITP10721 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KITP10721 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KITP10721 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KITP10721 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KITP10721 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KITP10721 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KITP10721 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KITP10721 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KITP10721 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KITP10721 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KITP10721 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KITP10721 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KITP10721 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KITP10721 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KITP10721 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KITP10721 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KITP10721 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KITP10721 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KITP10721 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KITP10721 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KITP10721 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KITP10721 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KITP10721 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KITP10721 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KITP10721 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KITP10721 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KITP10721 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KITP10721 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KITP10721 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KITP10721 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KITP10721 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KITP10721 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KITP10721 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms