Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD3P0DMS9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMIGD3P0DMS9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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