Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APELAP0DMC3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APELAP0DMC3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APELAP0DMC3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APELAP0DMC3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APELAP0DMC3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APELAP0DMC3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APELAP0DMC3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
APELAP0DMC3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APELAP0DMC3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APELAP0DMC3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
APELAP0DMC3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
APELAP0DMC3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
APELAP0DMC3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
APELAP0DMC3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APELAP0DMC3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APELAP0DMC3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms