Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBBP0CG47 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
UBBP0CG47 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms