Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFKMP08237 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PFKMP08237 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFKMP08237 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFKMP08237 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFKMP08237 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFKMP08237 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFKMP08237 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFKMP08237 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PFKMP08237 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFKMP08237 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFKMP08237 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PFKMP08237 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFKMP08237 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFKMP08237 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PFKMP08237 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKMP08237 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKMP08237 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKMP08237 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PFKMP08237 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKMP08237 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKMP08237 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKMP08237 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKMP08237 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKMP08237 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PFKMP08237 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PFKMP08237 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PFKMP08237 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PFKMP08237 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PFKMP08237 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PFKMP08237 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PFKMP08237 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PFKMP08237 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PFKMP08237 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PFKMP08237 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PFKMP08237 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PFKMP08237 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PFKMP08237 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PFKMP08237 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PFKMP08237 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PFKMP08237 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKMP08237 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKMP08237 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKMP08237 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKMP08237 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKMP08237 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKMP08237 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKMP08237 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKMP08237 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PFKMP08237 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKMP08237 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKMP08237 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKMP08237 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKMP08237 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PFKMP08237 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PFKMP08237 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PFKMP08237 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PFKMP08237 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PFKMP08237 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PFKMP08237 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PFKMP08237 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PFKMP08237 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PFKMP08237 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PFKMP08237 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PFKMP08237 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PFKMP08237 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PFKMP08237 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PFKMP08237 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PFKMP08237 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PFKMP08237 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PFKMP08237 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PFKMP08237 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PFKMP08237 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKMP08237 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKMP08237 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKMP08237 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKMP08237 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PFKMP08237 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PFKMP08237 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PFKMP08237 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PFKMP08237 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PFKMP08237 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PFKMP08237 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PFKMP08237 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PFKMP08237 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PFKMP08237 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PFKMP08237 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PFKMP08237 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PFKMP08237 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PFKMP08237 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PFKMP08237 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PFKMP08237 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PFKMP08237 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PFKMP08237 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PFKMP08237 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PFKMP08237 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PFKMP08237 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PFKMP08237 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PFKMP08237 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PFKMP08237 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms