Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CENPBP07199 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CENPBP07199 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CENPBP07199 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CENPBP07199 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CENPBP07199 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CENPBP07199 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CENPBP07199 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CENPBP07199 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CENPBP07199 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CENPBP07199 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CENPBP07199 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CENPBP07199 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CENPBP07199 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CENPBP07199 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CENPBP07199 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CENPBP07199 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CENPBP07199 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CENPBP07199 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CENPBP07199 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CENPBP07199 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CENPBP07199 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CENPBP07199 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CENPBP07199 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CENPBP07199 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CENPBP07199 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CENPBP07199 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CENPBP07199 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CENPBP07199 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CENPBP07199 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CENPBP07199 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CENPBP07199 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CENPBP07199 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CENPBP07199 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CENPBP07199 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CENPBP07199 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CENPBP07199 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CENPBP07199 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CENPBP07199 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CENPBP07199 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CENPBP07199 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CENPBP07199 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CENPBP07199 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CENPBP07199 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CENPBP07199 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CENPBP07199 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CENPBP07199 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPBP07199 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CENPBP07199 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CENPBP07199 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CENPBP07199 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CENPBP07199 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CENPBP07199 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CENPBP07199 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CENPBP07199 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CENPBP07199 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CENPBP07199 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CENPBP07199 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPBP07199 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPBP07199 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPBP07199 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPBP07199 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPBP07199 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPBP07199 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CENPBP07199 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CENPBP07199 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CENPBP07199 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CENPBP07199 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CENPBP07199 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CENPBP07199 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CENPBP07199 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CENPBP07199 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CENPBP07199 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CENPBP07199 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CENPBP07199 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CENPBP07199 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CENPBP07199 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CENPBP07199 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CENPBP07199 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CENPBP07199 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CENPBP07199 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CENPBP07199 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CENPBP07199 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CENPBP07199 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CENPBP07199 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CENPBP07199 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CENPBP07199 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CENPBP07199 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CENPBP07199 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CENPBP07199 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CENPBP07199 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CENPBP07199 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CENPBP07199 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CENPBP07199 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CENPBP07199 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CENPBP07199 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CENPBP07199 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CENPBP07199 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CENPBP07199 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CENPBP07199 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms