Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT1P04264 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT1P04264 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT1P04264 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT1P04264 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT1P04264 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT1P04264 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT1P04264 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT1P04264 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT1P04264 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT1P04264 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT1P04264 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT1P04264 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT1P04264 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT1P04264 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT1P04264 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT1P04264 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT1P04264 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT1P04264 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT1P04264 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT1P04264 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT1P04264 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT1P04264 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT1P04264 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT1P04264 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT1P04264 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT1P04264 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT1P04264 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT1P04264 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT1P04264 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT1P04264 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT1P04264 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT1P04264 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT1P04264 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT1P04264 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT1P04264 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT1P04264 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT1P04264 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT1P04264 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT1P04264 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT1P04264 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT1P04264 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT1P04264 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT1P04264 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT1P04264 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT1P04264 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT1P04264 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT1P04264 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT1P04264 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT1P04264 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT1P04264 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT1P04264 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT1P04264 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT1P04264 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT1P04264 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT1P04264 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT1P04264 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT1P04264 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT1P04264 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT1P04264 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT1P04264 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT1P04264 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT1P04264 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT1P04264 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT1P04264 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT1P04264 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT1P04264 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT1P04264 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT1P04264 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT1P04264 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT1P04264 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT1P04264 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT1P04264 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT1P04264 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT1P04264 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT1P04264 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT1P04264 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT1P04264 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT1P04264 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT1P04264 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT1P04264 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT1P04264 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT1P04264 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT1P04264 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT1P04264 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT1P04264 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT1P04264 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT1P04264 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT1P04264 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT1P04264 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT1P04264 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT1P04264 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT1P04264 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT1P04264 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT1P04264 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT1P04264 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT1P04264 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT1P04264 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT1P04264 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT1P04264 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms