Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP1P03956 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP1P03956 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP1P03956 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP1P03956 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP1P03956 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP1P03956 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP1P03956 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP1P03956 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP1P03956 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP1P03956 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP1P03956 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP1P03956 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP1P03956 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP1P03956 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP1P03956 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP1P03956 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP1P03956 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP1P03956 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP1P03956 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP1P03956 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP1P03956 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP1P03956 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP1P03956 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP1P03956 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP1P03956 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP1P03956 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP1P03956 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP1P03956 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP1P03956 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP1P03956 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP1P03956 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP1P03956 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP1P03956 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP1P03956 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP1P03956 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP1P03956 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP1P03956 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP1P03956 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP1P03956 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP1P03956 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MMP1P03956 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MMP1P03956 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MMP1P03956 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP1P03956 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP1P03956 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP1P03956 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP1P03956 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP1P03956 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP1P03956 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MMP1P03956 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP1P03956 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP1P03956 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP1P03956 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP1P03956 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP1P03956 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP1P03956 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP1P03956 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP1P03956 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP1P03956 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MMP1P03956 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MMP1P03956 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MMP1P03956 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP1P03956 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP1P03956 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP1P03956 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MMP1P03956 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP1P03956 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP1P03956 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP1P03956 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP1P03956 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP1P03956 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP1P03956 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP1P03956 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP1P03956 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP1P03956 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP1P03956 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP1P03956 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP1P03956 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP1P03956 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP1P03956 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP1P03956 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP1P03956 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP1P03956 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP1P03956 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP1P03956 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP1P03956 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
MMP1P03956 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP1P03956 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP1P03956 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MMP1P03956 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP1P03956 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP1P03956 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP1P03956 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MMP1P03956 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP1P03956 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP1P03956 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP1P03956 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP1P03956 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP1P03956 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms