Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGGP02679 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGGP02679 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGGP02679 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FGGP02679 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGGP02679 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGGP02679 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGGP02679 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGGP02679 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FGGP02679 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGGP02679 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGGP02679 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGGP02679 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGGP02679 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGGP02679 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGGP02679 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGGP02679 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGGP02679 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGGP02679 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGGP02679 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGGP02679 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FGGP02679 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGGP02679 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGGP02679 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGGP02679 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FGGP02679 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGGP02679 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGGP02679 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGGP02679 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGGP02679 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGGP02679 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGGP02679 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGGP02679 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGGP02679 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGGP02679 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGGP02679 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGGP02679 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGGP02679 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGGP02679 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGGP02679 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FGGP02679 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGGP02679 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGGP02679 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FGGP02679 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGGP02679 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGGP02679 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGGP02679 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGGP02679 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FGGP02679 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGGP02679 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGGP02679 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGGP02679 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGGP02679 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGGP02679 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGGP02679 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGGP02679 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGGP02679 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGGP02679 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FGGP02679 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGGP02679 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGGP02679 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGGP02679 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGGP02679 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGGP02679 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGGP02679 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGGP02679 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGGP02679 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGGP02679 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FGGP02679 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGGP02679 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGGP02679 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGGP02679 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGGP02679 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGGP02679 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGGP02679 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGGP02679 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGGP02679 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGGP02679 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGGP02679 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGGP02679 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGGP02679 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGGP02679 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGGP02679 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGGP02679 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms