Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGHV3-33P01772 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181 ms