Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SERPINA1P01009 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINA1P01009 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms