Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN7O95471 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN7O95471 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN7O95471 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms