Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPO95166 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GABARAPO95166 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABARAPO95166 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms