Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RHOBTB3O94955 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RHOBTB3O94955 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOBTB3O94955 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms