Protein–RNA interactions for Protein: O75688

PPM1B, Protein phosphatase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1BO75688 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPM1BO75688 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPM1BO75688 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPM1BO75688 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPM1BO75688 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms