Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF40O75150 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF40O75150 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF40O75150 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF40O75150 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF40O75150 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF40O75150 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF40O75150 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF40O75150 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF40O75150 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF40O75150 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF40O75150 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF40O75150 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RNF40O75150 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF40O75150 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF40O75150 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF40O75150 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF40O75150 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF40O75150 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF40O75150 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF40O75150 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF40O75150 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF40O75150 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF40O75150 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF40O75150 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF40O75150 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF40O75150 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF40O75150 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF40O75150 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF40O75150 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF40O75150 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF40O75150 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF40O75150 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF40O75150 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF40O75150 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF40O75150 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF40O75150 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF40O75150 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF40O75150 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF40O75150 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF40O75150 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF40O75150 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF40O75150 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF40O75150 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF40O75150 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF40O75150 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF40O75150 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF40O75150 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF40O75150 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF40O75150 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF40O75150 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF40O75150 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF40O75150 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF40O75150 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF40O75150 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF40O75150 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF40O75150 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF40O75150 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF40O75150 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF40O75150 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF40O75150 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF40O75150 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF40O75150 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF40O75150 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF40O75150 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF40O75150 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF40O75150 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF40O75150 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF40O75150 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF40O75150 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF40O75150 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF40O75150 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF40O75150 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF40O75150 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF40O75150 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF40O75150 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF40O75150 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF40O75150 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF40O75150 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF40O75150 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF40O75150 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF40O75150 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF40O75150 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF40O75150 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF40O75150 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNF40O75150 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF40O75150 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF40O75150 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF40O75150 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF40O75150 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF40O75150 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF40O75150 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF40O75150 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF40O75150 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF40O75150 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF40O75150 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF40O75150 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF40O75150 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF40O75150 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF40O75150 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms