Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP3O75074 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP3O75074 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP3O75074 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP3O75074 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP3O75074 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP3O75074 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP3O75074 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP3O75074 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP3O75074 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP3O75074 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP3O75074 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP3O75074 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP3O75074 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP3O75074 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP3O75074 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP3O75074 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP3O75074 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP3O75074 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP3O75074 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP3O75074 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP3O75074 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP3O75074 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP3O75074 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP3O75074 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP3O75074 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP3O75074 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP3O75074 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP3O75074 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP3O75074 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP3O75074 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP3O75074 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP3O75074 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP3O75074 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP3O75074 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP3O75074 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP3O75074 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP3O75074 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP3O75074 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP3O75074 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP3O75074 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP3O75074 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP3O75074 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP3O75074 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP3O75074 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP3O75074 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP3O75074 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP3O75074 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP3O75074 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP3O75074 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP3O75074 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP3O75074 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP3O75074 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRP3O75074 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP3O75074 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP3O75074 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP3O75074 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP3O75074 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRP3O75074 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP3O75074 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP3O75074 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRP3O75074 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP3O75074 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP3O75074 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP3O75074 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP3O75074 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP3O75074 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP3O75074 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP3O75074 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRP3O75074 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP3O75074 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP3O75074 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP3O75074 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP3O75074 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRP3O75074 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRP3O75074 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP3O75074 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP3O75074 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP3O75074 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP3O75074 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRP3O75074 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP3O75074 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP3O75074 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP3O75074 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP3O75074 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP3O75074 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP3O75074 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRP3O75074 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRP3O75074 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRP3O75074 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRP3O75074 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRP3O75074 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRP3O75074 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRP3O75074 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRP3O75074 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRP3O75074 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRP3O75074 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRP3O75074 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRP3O75074 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRP3O75074 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms