Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARCH6O60337 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCH6O60337 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MARCH6O60337 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MARCH6O60337 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MARCH6O60337 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MARCH6O60337 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MARCH6O60337 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MARCH6O60337 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MARCH6O60337 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MARCH6O60337 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MARCH6O60337 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARCH6O60337 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARCH6O60337 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARCH6O60337 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARCH6O60337 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MARCH6O60337 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MARCH6O60337 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MARCH6O60337 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MARCH6O60337 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MARCH6O60337 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MARCH6O60337 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MARCH6O60337 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MARCH6O60337 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MARCH6O60337 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MARCH6O60337 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MARCH6O60337 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MARCH6O60337 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MARCH6O60337 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MARCH6O60337 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MARCH6O60337 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MARCH6O60337 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MARCH6O60337 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MARCH6O60337 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MARCH6O60337 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MARCH6O60337 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MARCH6O60337 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MARCH6O60337 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms