Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSTPIP1O43586 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSTPIP1O43586 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSTPIP1O43586 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSTPIP1O43586 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms