Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1GO43497 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1GO43497 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA1GO43497 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1GO43497 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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