Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC41.68■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SYNJ1O43426 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
SYNJ1O43426 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SYNJ1O43426 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SYNJ1O43426 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
SYNJ1O43426 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SYNJ1O43426 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SYNJ1O43426 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SYNJ1O43426 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
SYNJ1O43426 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
SYNJ1O43426 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SYNJ1O43426 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
SYNJ1O43426 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SYNJ1O43426 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
SYNJ1O43426 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SYNJ1O43426 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SYNJ1O43426 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
SYNJ1O43426 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SYNJ1O43426 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
SYNJ1O43426 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms