Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SIPA1L1O43166 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIPA1L1O43166 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIPA1L1O43166 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L1O43166 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIPA1L1O43166 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.7 ms