Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNN4O15554 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNN4O15554 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNN4O15554 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms