Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD3EAPO15446 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CD3EAPO15446 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD3EAPO15446 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms