Protein–RNA interactions for Protein: O15127

SCAMP2, Secretory carrier-associated membrane protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP2O15127 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAMP2O15127 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAMP2O15127 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAMP2O15127 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms