Protein–RNA interactions for Protein: O14843

FFAR3, Free fatty acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR3O14843 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FFAR3O14843 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FFAR3O14843 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FFAR3O14843 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FFAR3O14843 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FFAR3O14843 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FFAR3O14843 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FFAR3O14843 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FFAR3O14843 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FFAR3O14843 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FFAR3O14843 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FFAR3O14843 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FFAR3O14843 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FFAR3O14843 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FFAR3O14843 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FFAR3O14843 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms