Protein–RNA interactions for Protein: O00746

NME4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4O00746 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME4O00746 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME4O00746 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME4O00746 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME4O00746 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME4O00746 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME4O00746 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME4O00746 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME4O00746 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME4O00746 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME4O00746 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME4O00746 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME4O00746 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME4O00746 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NME4O00746 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME4O00746 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NME4O00746 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NME4O00746 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NME4O00746 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NME4O00746 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NME4O00746 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME4O00746 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NME4O00746 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NME4O00746 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME4O00746 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NME4O00746 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NME4O00746 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME4O00746 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME4O00746 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME4O00746 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME4O00746 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME4O00746 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NME4O00746 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME4O00746 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME4O00746 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NME4O00746 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME4O00746 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME4O00746 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME4O00746 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME4O00746 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME4O00746 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NME4O00746 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME4O00746 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME4O00746 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME4O00746 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME4O00746 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME4O00746 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NME4O00746 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME4O00746 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME4O00746 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME4O00746 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME4O00746 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME4O00746 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME4O00746 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME4O00746 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME4O00746 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NME4O00746 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME4O00746 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME4O00746 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME4O00746 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME4O00746 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NME4O00746 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME4O00746 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME4O00746 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME4O00746 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME4O00746 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME4O00746 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME4O00746 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME4O00746 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NME4O00746 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME4O00746 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NME4O00746 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME4O00746 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NME4O00746 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME4O00746 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME4O00746 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME4O00746 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NME4O00746 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME4O00746 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME4O00746 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME4O00746 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME4O00746 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME4O00746 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME4O00746 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME4O00746 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME4O00746 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME4O00746 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NME4O00746 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME4O00746 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME4O00746 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME4O00746 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NME4O00746 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME4O00746 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME4O00746 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NME4O00746 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NME4O00746 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NME4O00746 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME4O00746 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME4O00746 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NME4O00746 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms