Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRPO00591 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRPO00591 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRPO00591 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABRPO00591 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRPO00591 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRPO00591 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABRPO00591 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRPO00591 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRPO00591 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRPO00591 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRPO00591 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRPO00591 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRPO00591 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRPO00591 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRPO00591 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRPO00591 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRPO00591 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRPO00591 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRPO00591 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRPO00591 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRPO00591 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRPO00591 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRPO00591 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRPO00591 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRPO00591 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRPO00591 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRPO00591 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRPO00591 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRPO00591 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRPO00591 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRPO00591 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRPO00591 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRPO00591 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRPO00591 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRPO00591 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRPO00591 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRPO00591 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRPO00591 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRPO00591 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRPO00591 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRPO00591 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRPO00591 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRPO00591 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRPO00591 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRPO00591 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRPO00591 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRPO00591 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRPO00591 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRPO00591 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRPO00591 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRPO00591 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRPO00591 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRPO00591 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRPO00591 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRPO00591 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRPO00591 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRPO00591 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRPO00591 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRPO00591 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRPO00591 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRPO00591 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRPO00591 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRPO00591 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRPO00591 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRPO00591 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRPO00591 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRPO00591 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRPO00591 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRPO00591 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRPO00591 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRPO00591 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRPO00591 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRPO00591 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRPO00591 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRPO00591 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRPO00591 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRPO00591 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRPO00591 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRPO00591 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRPO00591 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRPO00591 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRPO00591 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRPO00591 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRPO00591 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRPO00591 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRPO00591 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRPO00591 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRPO00591 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRPO00591 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRPO00591 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRPO00591 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRPO00591 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRPO00591 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRPO00591 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRPO00591 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRPO00591 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRPO00591 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRPO00591 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRPO00591 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms