Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBXN8O00124 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBXN8O00124 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBXN8O00124 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBXN8O00124 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms