Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QR89 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QR89 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QR89 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QR89 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QR89 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QR89 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QR89 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3QR89 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3QR89 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3QR89 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3QR89 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3QR89 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3QR89 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
J3QR89 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
J3QR89 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
J3QR89 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
J3QR89 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
J3QR89 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3QR89 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3QR89 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3QR89 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QR89 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QR89 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QR89 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QR89 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QR89 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QR89 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QR89 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QR89 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3QR89 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3QR89 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3QR89 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3QR89 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3QR89 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3QR89 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3QR89 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3QR89 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QR89 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QR89 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QR89 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QR89 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QR89 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QR89 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QR89 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QR89 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QR89 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QR89 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QR89 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QR89 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QR89 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QR89 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QR89 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QR89 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QR89 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QR89 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QR89 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QR89 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QR89 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QR89 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
J3QR89 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QR89 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QR89 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QR89 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QR89 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QR89 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QR89 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QR89 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
J3QR89 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QR89 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QR89 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QR89 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
J3QR89 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QR89 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QR89 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QR89 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QR89 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QR89 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QR89 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QR89 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QR89 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QR89 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QR89 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QR89 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
J3QR89 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QR89 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QR89 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QR89 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QR89 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QR89 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QR89 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
J3QR89 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QR89 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QR89 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QR89 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QR89 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QR89 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QR89 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QR89 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
J3QR89 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms