Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
H7C1D1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
H7C1D1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
H7C1D1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
H7C1D1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
H7C1D1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
H7C1D1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
H7C1D1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
H7C1D1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
H7C1D1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1D1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1D1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1D1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1D1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1D1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1D1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1D1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1D1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1D1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
H7C1D1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
H7C1D1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
H7C1D1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
H7C1D1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
H7C1D1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
H7C1D1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
H7C1D1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
H7C1D1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
H7C1D1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
H7C1D1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
H7C1D1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
H7C1D1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
H7C1D1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
H7C1D1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
H7C1D1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
H7C1D1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
H7C1D1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
H7C1D1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
H7C1D1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
H7C1D1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
H7C1D1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
H7C1D1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
H7C1D1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
H7C1D1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
H7C1D1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
H7C1D1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
H7C1D1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
H7C1D1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
H7C1D1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
H7C1D1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
H7C1D1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
H7C1D1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
H7C1D1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
H7C1D1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
H7C1D1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
H7C1D1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
H7C1D1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
H7C1D1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
H7C1D1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
H7C1D1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
H7C1D1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
H7C1D1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
H7C1D1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
H7C1D1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
H7C1D1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
H7C1D1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
H7C1D1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
H7C1D1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
H7C1D1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
H7C1D1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
H7C1D1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
H7C1D1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
H7C1D1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
H7C1D1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
H7C1D1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
H7C1D1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
H7C1D1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
H7C1D1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
H7C1D1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
H7C1D1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
H7C1D1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
H7C1D1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
H7C1D1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
H7C1D1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
H7C1D1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
H7C1D1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
H7C1D1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
H7C1D1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
H7C1D1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
H7C1D1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
H7C1D1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
H7C1D1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1D1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1D1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1D1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1D1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1D1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1D1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
H7C1D1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
H7C1D1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
H7C1D1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms