Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GABARAPH6UMI1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABARAPH6UMI1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABARAPH6UMI1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms