Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PBE3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PBE3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PBE3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E9PBE3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PBE3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PBE3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PBE3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PBE3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E9PBE3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PBE3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PBE3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PBE3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PBE3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PBE3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E9PBE3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PBE3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PBE3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PBE3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PBE3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E9PBE3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PBE3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PBE3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PBE3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PBE3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PBE3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E9PBE3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PBE3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PBE3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PBE3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PBE3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PBE3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PBE3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PBE3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PBE3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PBE3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E9PBE3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PBE3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PBE3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PBE3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PBE3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PBE3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PBE3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E9PBE3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E9PBE3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
E9PBE3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E9PBE3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PBE3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PBE3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PBE3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PBE3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PBE3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PBE3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PBE3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E9PBE3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E9PBE3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E9PBE3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
E9PBE3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E9PBE3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
E9PBE3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PBE3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PBE3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PBE3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
E9PBE3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PBE3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PBE3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PBE3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PBE3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PBE3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PBE3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
E9PBE3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PBE3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PBE3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PBE3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PBE3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PBE3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PBE3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PBE3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PBE3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PBE3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
E9PBE3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PBE3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PBE3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PBE3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PBE3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PBE3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
E9PBE3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PBE3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PBE3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PBE3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PBE3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PBE3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PBE3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PBE3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PBE3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PBE3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PBE3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
E9PBE3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PBE3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
E9PBE3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms