Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH2

KDM4E, Lysine-specific demethylase 4E, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4EB2RXH2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4EB2RXH2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4EB2RXH2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4EB2RXH2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4EB2RXH2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4EB2RXH2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4EB2RXH2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM4EB2RXH2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4EB2RXH2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4EB2RXH2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4EB2RXH2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4EB2RXH2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4EB2RXH2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4EB2RXH2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4EB2RXH2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM4EB2RXH2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KDM4EB2RXH2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM4EB2RXH2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4EB2RXH2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms