Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMCO5BA8MYB1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMCO5BA8MYB1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO5BA8MYB1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms