Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NL46 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NL46 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NL46 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NL46 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NL46 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NL46 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NL46 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NL46 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NL46 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NL46 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A6NL46 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NL46 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NL46 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NL46 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NL46 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NL46 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NL46 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NL46 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A6NL46 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A6NL46 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
A6NL46 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NL46 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NL46 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NL46 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NL46 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NL46 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A6NL46 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NL46 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NL46 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NL46 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A6NL46 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NL46 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NL46 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NL46 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NL46 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NL46 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NL46 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NL46 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NL46 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NL46 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A6NL46 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NL46 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NL46 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NL46 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NL46 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NL46 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NL46 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NL46 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A6NL46 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NL46 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NL46 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NL46 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NL46 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NL46 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NL46 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NL46 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NL46 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NL46 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A6NL46 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NL46 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NL46 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NL46 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NL46 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NL46 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NL46 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NL46 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A6NL46 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NL46 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NL46 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NL46 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A6NL46 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A6NL46 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NL46 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NL46 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NL46 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NL46 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NL46 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NL46 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NL46 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NL46 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NL46 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NL46 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NL46 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NL46 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NL46 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NL46 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NL46 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NL46 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NL46 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NL46 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NL46 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NL46 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NL46 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NL46 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NL46 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NL46 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NL46 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NL46 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NL46 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms