Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM247A6NEH6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM247A6NEH6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms