Protein–RNA interactions for Protein: A6NDZ8

MBD3L4, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L4A6NDZ8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MBD3L4A6NDZ8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD3L4A6NDZ8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD3L4A6NDZ8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms