Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH32

IGHV3-20, Immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20A0A0C4DH32 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV3-20A0A0C4DH32 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGHV3-20A0A0C4DH32 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV3-20A0A0C4DH32 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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