Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
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