Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A8Q9Y2E8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms