Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TNFSF18Q9UNG2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms