Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALD1Q9ULE6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms