Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms